MRSA分成社區型與院內型MRSA，社區型CA-MRSA抗藥性相對低一些，針對這種低抗藥性MRSA在檢驗時要更加小心。有時候檢驗結果Oxacillin: S，你以為是MSSA，結果給病人IV oxacillin卻病情惡化。可能是因為這隻CA-MRSA屬於低抗藥性，在體外因為菌量少，檢驗用的oxa藥錠有效，但體內就失敗了。
細菌在培養皿上是否會被抗生素殺掉，有很多影響陰因子：接種菌量(inoculum effect)、細菌的菌落堆積(劃培養皿的技術不好)、培養的時間、溫度、pH值及 NaCl的濃度等。有抑菌圈不代表在你體內的細菌100%能被抗生素殺掉，所以檢驗學一直在作研究，希望找到較好的實驗條件與敏感性、專一性較高的抗生素來反應MRSA的抗藥性。
MRSA的抗藥性主要是因為S.aureus獲得mecA基因，可轉譯出penicillin-binding
protein 2a (PBP 2a)，他與oxacillin的親和性差，是謂oxacillin resistance-MRSA。SCCmec為一大型基因載體，類似以前學的細菌質體(plasmid)上面承載著mecA，而這種SCCmec共有13型，type1、2、3為大型載體除了有mecA還有其他抗藥基因，而type 4、5就小一點只有mecA。HA-MRSA帶有type 1、2或3所以除了抗oxa之外，也抗moxi、doxy、baktar之類的。CA-MRSA僅帶type4或5所以只抗oxa，還有很多抗生素可用。
根據多項研究發現，低抗藥性MRSA的mecA基因表現具有是異質性 (heterogeneous)，不同溫度、PH、NaCl濃度、菌量都會影響其表現，而造成檢驗結果誤判。黃金準則當然是做PCR驗到mecA基因，但就花時間又花錢。從2004年起CLSI首次推薦使用cefoxitin紙錠擴散法來檢測 MRSA，其敏感性較高、專一性較高、培養時間短(cefoxitin 24hr, oxa >40hr)、界線明顯較容易判讀： 調製成濁度0.5 McFarland的懸浮菌液，以棉棒塗抹於Mueller-Hinton agar培養基，貼上 30 µg cefoxitin紙錠，在35℃下培養24小時，以反射光(reflected light)直接判讀: ≦21 mm為oxacillin R、>21mm為S。也是很直觀，不像clindamycin要做D test
以北榮的檢驗為例:
Cefoxitin Screen (+) 解讀為Cefoxitin induced mecA基因 (+) = oxa沒效
Inducible Clindamycin Resistance (+) 解讀為Clindamycin induced
erm基因 (+)=clinda沒效
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